Saat ini ia bermain untuk Sportivo Ameliano, mengenakan kaus bernomor 6. Ia bermain terutama sebagai Gelandang. Tinggi badannya 179 cm dan berat badannya 76 kg.

Dalam 8 penampilan di Divisi Pertama Paraguay 2026, Jonathan Daniel Benítez Benítez mencatatkan 0 gol dan 0 assist, sambil menyelesaikan 3 umpan kunci dari total 289 umpan dengan akurasi passing 27.9.