Saat ini ia bermain untuk BK Frem, mengenakan kaus bernomor 3. Ia bermain terutama sebagai Bek.

Perpindahan terakhirnya adalah dari FC Svendborg ke BK Frem pada 2020-08-01.

Sepanjang Piala Denmark 2024-2025, Emil Schou Jørgensen tampil dalam 4 pertandingan, dengan rata-rata 0.5 tekel, 1 intersepsi, dan 1 sapuan per pertandingan, serta memblokir 0 tembakan per pertandingan.