Ia bermain terutama sebagai Penyerang.

Perpindahan terakhirnya adalah dari Kerala United FC ke East Bengal FC II pada 2022-09-24.

Pada musim Liga Tantangan AFC 2024-2025, Jesin Thonikkara mencetak 0 gol dan memberikan 0 assist dalam 4 penampilan, dengan rata-rata 0 gol per pertandingan dari 0 percobaan tembakan dan 0 tepat sasaran.