Saat ini ia bermain untuk Nacional Potosi, mengenakan kaus bernomor 3. Ia bermain terutama sebagai Bek.

Sepanjang Divisi Pertama Bolivia 2025, Javier Guerra tampil dalam 28 pertandingan, dengan rata-rata 0.3 tekel, 0.1 intersepsi, dan 0.3 sapuan per pertandingan, serta memblokir 0 tembakan per pertandingan.