Di tingkat internasional, ia mewakili Kosovo U17. Ia bermain terutama sebagai Penyerang.

Pada musim Ramah Klub Internasional 2025, Agon Uka mencetak 0 gol dan memberikan 0 assist dalam 1 penampilan, dengan rata-rata 0 gol per pertandingan dari 0 percobaan tembakan dan 0 tepat sasaran.